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Invitrogen™ GLOBINclear™ Kit, mouse/rat, for globin mRNA depletion
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Menge:
20 Aufreinigungen
Packungsgröße:
1 Stück
Beschreibung
Includes
20 μl Capture Oligo-Gemsich; 600μl Streptavidin-Magnetbeads; 1,5 ml 2x-Hybridisierungspuffer; 1,5 ml Streptavidin-Bead-Puffer; 1,75 nukleasefreies Wasser; 200 μl RNA-Bindungsbeads; 5 ml RNA-Waschlösungskonzentrat; 1 ml Elutionspuffer; 80 μl RNA-Beadpuffer; 4 ml RNA-Bindungspufferkonzentrat; 100 1,5 ml-Antihaftröhrchen
Benötigt
Das Kit muss mit einem magnetischen Stativ verwendet werden. Der Magnetfuß für 6 Röhrchen (Kat.-Nr. AM10055) kann sechs separate konische 1,5 ml-Mikrozentrifugenröhrchen oder 2 ml-Mikroröhrchen mit rundem Boden und einem Durchmesser von 8 bis 10 mm aufnehmen.
Das Ambion™ GLOBINclear™-Maus-/Ratten-Kit verwendet eine neuartige, nicht-enzymatische Technologie, die schnell > 95 % der Alpha- und Beta-Globin-mRNA aus Gesamt-RNA-Präparaten aus Vollblut abbaut. Das Kit enthält genügend Reagenzien für 20 Reaktionen.
• Entfernt >95 % unerwünschter Globin-mRNA aus der Gesamt-RNA im Vollblut
• Erkennt bis zu 50 % mehr Gene —Analyse bisher unerkannter Gene
• Eine bessere Genomdarstellung und niedrige 3'-/5'-Verhältnisse
• Vermeidet RNase H-Behandlungen, die mRNA abbauen und Expressionsprofile modifizieren können
Verwendung von Gesamt-RNA-Vollblutproben
Es ist allgemein bekannt, dass Daten für Expressionsarrays, die aus Gesamt-RNA-Vollblutproben gewonnen wurden, eine geringere Detektionsempfindlichkeit als Daten aus fraktionierten Blutproben aufweisen. Die Untersuchung der Gesamt-RNA aus Vollblut zeigt eine dominante Bande im Bereich von 600–700 Basen. Diese Bande repräsentiert Globin mRNA, die in hohen Konzentrationen in roten Blutkörperchen (RBCs) und Retikulozyten (RBC-Vorläufer) exprimiert wird. Bis zu 70 % der mRNA (Massenanteil) der Gesamt-RNA aus Vollblut sind Globin-Transkripte. Die Array-Analyse mittels Gesamt-RNA mit einem hohen Anteil an Globin-mRNA zeigte die folgenden Ergebnisse:
• Verringert vorhandene Call
• Verringerung der Call-Konkordanz
• Erhöhung der Signalvariation
Das GLOBINclear™ Kit verwendet eine neuartige Hybridisierungstechnologie, die die Stärke der Biotin-Streptavidin-Bindung, die Spezifität der Nukleinsäure-Hybridisierung und den Komfort magnetischer Trennungen nutzt. Es gibt keine aggressiven enzymatischen Behandlungen mit RNase H, die das Expressionsprofil durch den Abbau von anderen mRNAs als Globin mRNA beeinträchtigen können. Die daraus resultierende mRNA ist ein überlegenes Template für die Synthese markierter cDNA für die Array-Analyse und eignet sich ideal für die quantitative RT-PCR. Die Anreicherung führt zu einer deutlichen prozentualen Steigerung der aktuellen Calls, einer verringerten Variabilität zwischen den Proben und einem niedrigen 3'/5'-Verhältnis.
Zubehörprodukt:
Das Kit erfordert die Verwendung eines Magnetständers. Der Magnetständer für 6 Röhrchen (SKU-Nr. AM10055) kann sechs separate konische 1,5 ml-Mikrozentrifugenröhrchen oder 2 ml-Mikroröhrchen mit rundem Boden und einem Durchmesser von 8 – 10 mm aufnehmen.
• Entfernt >95 % unerwünschter Globin-mRNA aus der Gesamt-RNA im Vollblut
• Erkennt bis zu 50 % mehr Gene —Analyse bisher unerkannter Gene
• Eine bessere Genomdarstellung und niedrige 3'-/5'-Verhältnisse
• Vermeidet RNase H-Behandlungen, die mRNA abbauen und Expressionsprofile modifizieren können
Verwendung von Gesamt-RNA-Vollblutproben
Es ist allgemein bekannt, dass Daten für Expressionsarrays, die aus Gesamt-RNA-Vollblutproben gewonnen wurden, eine geringere Detektionsempfindlichkeit als Daten aus fraktionierten Blutproben aufweisen. Die Untersuchung der Gesamt-RNA aus Vollblut zeigt eine dominante Bande im Bereich von 600–700 Basen. Diese Bande repräsentiert Globin mRNA, die in hohen Konzentrationen in roten Blutkörperchen (RBCs) und Retikulozyten (RBC-Vorläufer) exprimiert wird. Bis zu 70 % der mRNA (Massenanteil) der Gesamt-RNA aus Vollblut sind Globin-Transkripte. Die Array-Analyse mittels Gesamt-RNA mit einem hohen Anteil an Globin-mRNA zeigte die folgenden Ergebnisse:
• Verringert vorhandene Call
• Verringerung der Call-Konkordanz
• Erhöhung der Signalvariation
Das GLOBINclear™ Kit verwendet eine neuartige Hybridisierungstechnologie, die die Stärke der Biotin-Streptavidin-Bindung, die Spezifität der Nukleinsäure-Hybridisierung und den Komfort magnetischer Trennungen nutzt. Es gibt keine aggressiven enzymatischen Behandlungen mit RNase H, die das Expressionsprofil durch den Abbau von anderen mRNAs als Globin mRNA beeinträchtigen können. Die daraus resultierende mRNA ist ein überlegenes Template für die Synthese markierter cDNA für die Array-Analyse und eignet sich ideal für die quantitative RT-PCR. Die Anreicherung führt zu einer deutlichen prozentualen Steigerung der aktuellen Calls, einer verringerten Variabilität zwischen den Proben und einem niedrigen 3'/5'-Verhältnis.
Zubehörprodukt:
Das Kit erfordert die Verwendung eines Magnetständers. Der Magnetständer für 6 Röhrchen (SKU-Nr. AM10055) kann sechs separate konische 1,5 ml-Mikrozentrifugenröhrchen oder 2 ml-Mikroröhrchen mit rundem Boden und einem Durchmesser von 8 – 10 mm aufnehmen.
Bestellinformation
Versandbedingung: Nass- oder Trockeneis
Spezifikation
Spezifikation
| Produkttyp | Maus-/Ratten-Kit |
| Inhalt und Lagerung | • 20 µl Capture-Oligo-Gemisch (-20 °C) • 600 µl Streptavidin Magnetische Beads (4 °C—nicht einfrieren) • 1,5 ml 2X Hybridisierungspuffer (Raumtemperatur) • 1,5 ml Streptavidin Bead-Puffer (Raumtemperatur) • 1,75 nukleasefreies Wasser (-20 °C, 4 °C oder Raumtemperatur) • 200 µl RNA-Bindungs-Beads (4 °C—nicht einfrieren) • 5 ml RNA-Waschlösungskonzentrat (4 °C oder Raumtemperatur) • 1 ml Elutionspuffer (4 °C oder Raumtemperatur) • 80 µl RNA-Bead-Puffer (Raumtemperatur) • 4 ml RNA-Bindungspuffer-Konzentrat (Raumtemperatur) • 100 1,5 ml-Antihaftröhrchen (Raumtemperatur) |
| Endprodukttyp | Gesamt-RNA (Globin mRNA-arm) |
| Hochdurchsatz-Kompatibilität | Geeignet für hohe Durchsätze |
| Probentyp | Gesamt-RNA (Vollblut) |
| Spezies | Maus, Ratte |
| Format | Mikroröhrchen |
| Produktlinie | Ambion™, GLOBINclear™ |
| Zur Verwendung mit (Anwendung) | Microarray-Analyse, quantitative Echtzeit-PCR (qPCR), Reverse-Transkriptase-PCR (RT-PCR), Northern Blotting, cDNA-Bibliothekserstellung |
| Menge | 20 Aufreinigungen |
Nur für Forschungszwecke. Nicht zur Verwendung bei diagnostischen Verfahren.
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